激酶重組蛋白在三維結(jié)構(gòu)上具有高度的保守性,特別是在催化活性ATP結(jié)構(gòu)域附近。該區(qū)域包括一個多由β-折疊構(gòu)成的N端-lobe區(qū)域及由α-螺旋構(gòu)成的C端-lobe區(qū)域,而ATP結(jié)合在兩者之間構(gòu)成的溝狀區(qū),也是多數(shù)激酶小分子抑制劑的直接競爭結(jié)合位點(diǎn)。
激酶重組蛋白作為藥物靶點(diǎn)起步較晚,且很多潛力型針對激酶的藥物仍在臨床研究中。對于一些已經(jīng)過深入探索的家族,如類胰蛋白酶絲氨酸蛋白酶,已有數(shù)據(jù)表明該類家族的成藥性比較低。另外,根據(jù)基于數(shù)據(jù)的分析,我們也可預(yù)測某些家族在藥物研發(fā)中的表現(xiàn),如有超過40種的p38α抑制劑進(jìn)入了臨床研究,但通常僅為進(jìn)展到或停滯于期臨床階段。對激酶家族而言,靶點(diǎn)及對應(yīng)藥物占比差異較大,主要原因在于蛋白激酶的小分子抑制劑通常具有廣譜作用性,同一種藥物可做用于多種激酶成員。
蛋白激酶主要分為兩大類,即絲氨酸/蘇氨酸激酶和酪氨酸激酶。有時,蛋白激酶也可以分為7類,即AGC激酶類,包括PKA、PKC和PKG;CaM激酶類包括鈣調(diào)蛋白酶;CK1類,包括酪蛋白1;CMGC類,包括CDK、MAPK、GSK3和CLK;STE類;TK酪氨酸激酶類;TKL類。還可進(jìn)一步細(xì)分,如根據(jù)酪氨酸激酶是否存在于細(xì)胞表面,可將90個酪氨酸激酶分為受體酪氨酸激酶(RTK,58個)和非受體酪氨酸激酶(NRTK,32個)。受體酪氨酸激酶又可以細(xì)分為20個亞類。
根據(jù)多年的總結(jié),為節(jié)約用戶經(jīng)費(fèi),選取常用于檢測的一批激酶靶點(diǎn),制成一個激酶panel,用于激酶譜的篩選,站在用戶角度,讓用戶在經(jīng)費(fèi)緊張的情況下,盡量能更多的獲得實(shí)驗(yàn)信息。